#include<stdio.h> #include<stdlib.h> #include<message.h> #include<vector> #include"poszukiwania.h" //#define DEBUG #ifdef DEBUG #define log(format, ...) fprintf(stderr, format "\n", ##__VA_ARGS__) #else #define log(...) #endif using namespace std; int from=1; //!< Zakres początkowy danych (+1) int sLen; //!< długość sygnału int mLen; //!< długość ciągu matematycznego int chckLen; //!< Długość danych do sprawdzania (mLen-sLen) inline int x(int pos) { return SignalAt(pos+1); } inline int y(int pos) { return SeqAt(pos+from); } inline bool check(int pos) { pos+=from-1; for(int j=1;j<=sLen;++j) { if(SignalAt(j)!=SeqAt(j+pos)) return false; // jeżeli jest miejsce niepazujące, to zwracamy false } return true; // jeżeli wszystkie elementy się zgadzają } /* Computing of the maximal suffix for <= */ int maxSuf(int m, int *p) { int ms, j, k; char a, b; ms = -1; j = 0; k = *p = 1; while (j + k < m) { a = x(j + k); b = x(ms + k); if (a < b) { j += k; k = 1; *p = j - ms; } else if (a == b) if (k != *p) ++k; else { j += *p; k = 1; } else { /* a > b */ ms = j; j = ms + 1; k = *p = 1; } } return(ms); } /* Computing of the maximal suffix for >= */ int maxSufTilde(int m, int *p) { int ms, j, k; char a, b; ms = -1; j = 0; k = *p = 1; while (j + k < m) { a = x(j + k); b = x(ms + k); if (a > b) { j += k; k = 1; *p = j - ms; } else if (a == b) if (k != *p) ++k; else { j += *p; k = 1; } else { /* a < b */ ms = j; j = ms + 1; k = *p = 1; } } return(ms); } int cmp(int k, int len) { for(int i=0;i<len;++i) if(x(i)!=x(k+i)) return false; return true; } int MAX(int a, int b) { return a>b?a:b; } /* Two Way string matching algorithm. */ int TW() { int i, j, ell, memory, p, per, q; int m=sLen; int n=mLen; int res=0; /* Preprocessing */ i = maxSuf(m, &p); j = maxSufTilde(m, &q); if (i > j) { ell = i; per = p; } else { ell = j; per = q; } /* Searching */ if ( cmp(per, ell + 1) ) { j = 0; memory = -1; while (j <= n - m) { i = MAX(ell, memory) + 1; while (i < m && x(i) == y(i + j) ) ++i; if (i >= m) { i = ell; while (i > memory && x(i) == y(i + j) ) --i; if (i <= memory) ++res; j += per; memory = m - per - 1; } else { j += (i - ell); memory = -1; } } } else { per = MAX(ell + 1, m - ell - 1) + 1; j = 0; while (j <= n - m) { i = ell + 1; while (i < m && x(i) == y(i + j)) ++i; if (i >= m) { i = ell; while (i >= 0 && x(i) == y(i + j) ) --i; if (i < 0) ++res; j += per; } else j += (i - ell); } } return res; } int main(int argc, char** argv) { sLen=SignalLength(); mLen=SeqLength(); // Każy wykonuje 1/n pracy i zrzuca wyniki if(mLen<NumberOfNodes()*100) //if(false) { // jeżeli jest mało zadań, to wykonujemy na jednym komputerze if(MyNodeId()!=0) return 0; log("Small data node"); // prostą metodą int chckLen=mLen-sLen; int res=0; for(int i=0;i<chckLen;++i) { if(check(i)) ++res; } printf("%d\n",res); // wypisujemy wsumaryczny wynik return 0; } // tryb pracy na wielu komputerach int part=(mLen-SignalLength()+NumberOfNodes()-1)/NumberOfNodes(); // jedna paczka danych from=MyNodeId()*part; mLen=part+SignalLength()-1; if(mLen+from>SeqLength()) mLen=SeqLength()-from; log("Multinode from %d to %d (%d) of %d", from, mLen+from-1, mLen, (int)SeqLength()); from=from+1; int res; if(sLen<10) { // to wykonujemy zwykłą metodą, bo narzut będzie zbyt duży log("Small pattern mode"); int chckLen=mLen-sLen; res=0; for(int i=0;i<chckLen;++i) { if(check(i)) ++res; } } else { // uruchomienie kompletnego algorytmu "Two Way" res=TW(); } if(MyNodeId()>0) { // to odsyłamy wyniki to 0-rowego log("Node %d sending result to core", MyNodeId()); PutInt(0,res); Send(0); return 0; // i kończym prace } // jak jesteśmy zerowym, to zbieramy wyniki od pozostałych for(int i=1;i<NumberOfNodes();++i) { Receive(i); int cres=GetInt(i); res+=cres; log("Received summary from node: %d = %d",i,cres); } printf("%d\n",res); // wypisujemy wsumaryczny wynik return 0; }
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 | #include<stdio.h> #include<stdlib.h> #include<message.h> #include<vector> #include"poszukiwania.h" //#define DEBUG #ifdef DEBUG #define log(format, ...) fprintf(stderr, format "\n", ##__VA_ARGS__) #else #define log(...) #endif using namespace std; int from=1; //!< Zakres początkowy danych (+1) int sLen; //!< długość sygnału int mLen; //!< długość ciągu matematycznego int chckLen; //!< Długość danych do sprawdzania (mLen-sLen) inline int x(int pos) { return SignalAt(pos+1); } inline int y(int pos) { return SeqAt(pos+from); } inline bool check(int pos) { pos+=from-1; for(int j=1;j<=sLen;++j) { if(SignalAt(j)!=SeqAt(j+pos)) return false; // jeżeli jest miejsce niepazujące, to zwracamy false } return true; // jeżeli wszystkie elementy się zgadzają } /* Computing of the maximal suffix for <= */ int maxSuf(int m, int *p) { int ms, j, k; char a, b; ms = -1; j = 0; k = *p = 1; while (j + k < m) { a = x(j + k); b = x(ms + k); if (a < b) { j += k; k = 1; *p = j - ms; } else if (a == b) if (k != *p) ++k; else { j += *p; k = 1; } else { /* a > b */ ms = j; j = ms + 1; k = *p = 1; } } return(ms); } /* Computing of the maximal suffix for >= */ int maxSufTilde(int m, int *p) { int ms, j, k; char a, b; ms = -1; j = 0; k = *p = 1; while (j + k < m) { a = x(j + k); b = x(ms + k); if (a > b) { j += k; k = 1; *p = j - ms; } else if (a == b) if (k != *p) ++k; else { j += *p; k = 1; } else { /* a < b */ ms = j; j = ms + 1; k = *p = 1; } } return(ms); } int cmp(int k, int len) { for(int i=0;i<len;++i) if(x(i)!=x(k+i)) return false; return true; } int MAX(int a, int b) { return a>b?a:b; } /* Two Way string matching algorithm. */ int TW() { int i, j, ell, memory, p, per, q; int m=sLen; int n=mLen; int res=0; /* Preprocessing */ i = maxSuf(m, &p); j = maxSufTilde(m, &q); if (i > j) { ell = i; per = p; } else { ell = j; per = q; } /* Searching */ if ( cmp(per, ell + 1) ) { j = 0; memory = -1; while (j <= n - m) { i = MAX(ell, memory) + 1; while (i < m && x(i) == y(i + j) ) ++i; if (i >= m) { i = ell; while (i > memory && x(i) == y(i + j) ) --i; if (i <= memory) ++res; j += per; memory = m - per - 1; } else { j += (i - ell); memory = -1; } } } else { per = MAX(ell + 1, m - ell - 1) + 1; j = 0; while (j <= n - m) { i = ell + 1; while (i < m && x(i) == y(i + j)) ++i; if (i >= m) { i = ell; while (i >= 0 && x(i) == y(i + j) ) --i; if (i < 0) ++res; j += per; } else j += (i - ell); } } return res; } int main(int argc, char** argv) { sLen=SignalLength(); mLen=SeqLength(); // Każy wykonuje 1/n pracy i zrzuca wyniki if(mLen<NumberOfNodes()*100) //if(false) { // jeżeli jest mało zadań, to wykonujemy na jednym komputerze if(MyNodeId()!=0) return 0; log("Small data node"); // prostą metodą int chckLen=mLen-sLen; int res=0; for(int i=0;i<chckLen;++i) { if(check(i)) ++res; } printf("%d\n",res); // wypisujemy wsumaryczny wynik return 0; } // tryb pracy na wielu komputerach int part=(mLen-SignalLength()+NumberOfNodes()-1)/NumberOfNodes(); // jedna paczka danych from=MyNodeId()*part; mLen=part+SignalLength()-1; if(mLen+from>SeqLength()) mLen=SeqLength()-from; log("Multinode from %d to %d (%d) of %d", from, mLen+from-1, mLen, (int)SeqLength()); from=from+1; int res; if(sLen<10) { // to wykonujemy zwykłą metodą, bo narzut będzie zbyt duży log("Small pattern mode"); int chckLen=mLen-sLen; res=0; for(int i=0;i<chckLen;++i) { if(check(i)) ++res; } } else { // uruchomienie kompletnego algorytmu "Two Way" res=TW(); } if(MyNodeId()>0) { // to odsyłamy wyniki to 0-rowego log("Node %d sending result to core", MyNodeId()); PutInt(0,res); Send(0); return 0; // i kończym prace } // jak jesteśmy zerowym, to zbieramy wyniki od pozostałych for(int i=1;i<NumberOfNodes();++i) { Receive(i); int cres=GetInt(i); res+=cres; log("Received summary from node: %d = %d",i,cres); } printf("%d\n",res); // wypisujemy wsumaryczny wynik return 0; } |